生態環保廁所的出現時廁所發展史的必然結果。傳統的廁所每次使用需要消耗大量寶貴的水資源，排放大量污水，并且要定期清理，集中處理污泥，消耗大量人力物力，對環境造成很大的污染。而生態環保廁所不僅節約了水資源，且突破了傳統的概念，采用微生物基因技術，開發出了創新一代的環保無污染生態廁所。
  生態環保廁所是自身具備良性循環的廁所。生態環保廁所一般具有生態建筑的三個特點：一是地下要設有沼氣凈化池，而不是普通的沼氣池，這是一個核心設施；二是屋頂要覆土或設置太陽能利用裝置；三是墻體要垂直綠化，這樣，經過多年后，生態環保廁所就成為一個綠色的生態建筑。生態環保廁所的類型主要有園林式、綜合式、棚架式、普通式和風景游覽區式等。
  生態廁所主要是使用微生物進行分解，行業專家介紹，微生物主要可以分為以下兩類：厭氧型。厭氧型生態廁所的核心部件是一個裝填料的生物反應器。生物降解菌對糞便具有高效降解作用，同時反應過程產生的溫度可以殺滅各種病原菌。糞便發酵后變成腐殖質有機肥，這種肥料可以直接利用。由于主要采用厭氧發酵，產生的腐胺、尸胺及硫化氫等致臭物質較多，故臭氣污染較為嚴重。
  好氧型。好氧型生態廁所的核心技術是其將生物降解菌劑與生物反應器二者有效地結合，即在反應器內預先裝入生物填料，在一定的溫度下通過高效微生物充分降解糞便，同時將排泄物轉化成有機肥料。
  生態環保廁所還可進一步拓寬應用領域，如家用免水生態環保廁所、汽車用免水生態環保廁所、列車用免水生態環保廁所、船舶艦艇用免水生態環保廁所等等。生態環保廁所的研究成果將來也可應用于畜牧業的糞尿無害化處理，生態環保廁所具有巨大的應用空間。